Syyskuun keskilämpötila Zagrebissa on viime vuosina ollut 16 astetta. Öisin lämpötila on tyypillisesti laskenut 13 asteen tienoille, ja päivisin lämpötila on kohonnut 20 asteen tuntumaan. Viereisestä kaaviosta näkee, miten lämmintä Zagrebissa on keskimäärin ollut syyskuussa viime vuosina ja vaihteluväli, jolla lämpötila tavallisina päivinä on minäkin vuonna liikkunut.

Hetkellisesti Zagrebissa on silti koettu tätäkin kylmempiä ja kuumempia syyskuisia päiviä. Esimerkiksi vuoden 2013 syyskuussa lämpötila käväisi alimmillaan 7 asteessa ja toisaalta vuonna 2011 syyskuussa hätyyteltiin eräänä poikkeuksellisen lämpimänä päivänä 33 asteen lukemia.